公司现有普通箱、罐式箱和双层汽车箱等 9种不同箱型，保有量21.3万TEU，其中，20英尺普通箱12万只、40英尺箱0.5万只等 ；直属集装箱专办站6个；集装箱铁路专用平车8800辆；篷布33万张。公司将建设上海、昆明、哈尔滨、广州等18个具有国际先进技术装备和管理水平的铁路集装箱中心站，改造现有40个靠近省会城市、大型港口和主要内陆口岸的集装箱办理站和100个代办站，形成集装箱铁路运输网络。
公司已建成以箱号追踪为核心的运输管理系统，实现了全国客户的网络、电话服务功能，要通过整合公司现有信息资源，实现信息化的货票清算和成本控制，逐步建成统一的全国铁路集装箱营销系统。